1949年—1993年

◎　1949—1953年，寺无住僧，仅有一孤老居士以此为家，早晚上香。期间，大河某校教师率学生摧毁四祖寺铁铸千手观音、四大天王像，御赐玉印遗失。
◎　1953年，县政府建国营五祖寺林场总场，管理全县四山林木。四祖寺为其分场之一，殿堂作为分场办公、住宿、库房之用。
◎　1958年，湖北省人民政府颁文公布四祖寺毗卢塔、鲁班亭、衣钵塔为湖北省重点文物保护单位。
◎　1958年大办钢铁，黄梅四山百年林木尽遭砍伐，入炉成灰，四祖寺山区古树幸存无几，明荆王铸四祖宝像被砸，由区政府卖给废品收购站。
◎　1965年，县政府拨款，由五祖寺僧人海妙法师负责对毗卢塔进行第一次塔顶维修，在塔刹空洞覆盖汤镬堵漏。
◎　1960年---1970年间，为扩大耕地，劈山造田，实现田园化建设，四祖寺院外的东、西、北山坡上的三处塔林中的历代僧塔、僧墓，除几座体形较大者之外，都全部推倒，构件与墓碑被运往山下各村架桥造粪池。
◎　期间，一些颓废建筑全部拆毁，仅存祖爷殿、慈云阁二间，观音堂平房三间，慈云阁作大队部食堂，观音堂作村办小学。寺院荒芜宅基地全部改为林场果园。
◎　十年浩劫，大河区红卫兵来四祖寺破“四旧”，本已千疮百孔的四祖寺再遭摧残。至此，千年古刹洗劫一空。
◎　1979年日本水上勉、柳田圣山一行五人，由县政府外事办主任刘建雄、县文化馆桂遇秋陪同参拜四祖寺遗址。
◎　1982年，比丘尼觉道法师由花桥村（今改名四祖村）村民从紫云洞请来住进四祖寺残存的观音殿。周边各村与武穴双城驿一带善信自发前来帮助整理残存祖师殿及生活用房。中断十多年的四祖寺香火又重续点燃。
◎　1982年，全国文物普查中，四祖寺毗卢塔、鲁班厅、衣钵塔、明月桥、灵润桥与石刻群均被确认为省级以上的重点文物。
◎　1983年，湖北省人民政府颁文公布四祖寺上述古建筑群为湖北省重点文物保护单位。
◎　1985年，县文管所根据县政府安排为本县文物保护单位树立保护标志，对四祖寺古建筑进行了抢救性维修。
◎　1990年，县宗教局派从少林寺返乡的黄梅籍僧人行时提心法师管理四祖寺，觉道尼及其徒众仍留常住。
◎　1990年至1992年5月，县文化局工作组进驻四祖村（即花桥村）。工作组长、县文化局副局长黄雁同志申请县政府拨款，开辟从一天门经四祖寺到门坎山口的登山公路，这是破额山区的首建进山公路工程。公路绕道灵润桥北侧通过，在古桥之北新建钢筋混凝土单孔石桥一座。从此，灵润桥不准通行机动车，使古桥得到保护。
◎　1992年5月，县博物馆专业人员踏勘双峰尖，发现古砦遗址，又在门坎山口发现黑脸门生石塔。
◎　1993年9月，县博物馆业务人员一行，首次对毗卢塔、鲁班亭、衣钵塔实施测量，为申报全国重点文物保护单位作前期资料准备。首次在鲁班亭后侧发现建亭记事碑刻，记载鲁班亭建于宋元符二年（1095）二月二十日，由德化（今黄梅县）匠人卢仁仲设计施工。