参观日本寺院，会给人一种时光倒流、回到唐宋的感觉，他们的寺院建筑基本上保留的是中国唐宋时期的风格，至少是三五百年甚至上千年的历史，有的一直保存完好，有的则多次遭遇火灾后又屡次重建，重建时同样保留唐宋规制。
日本寺院建筑的特点是大气、壮阔、质朴、厚重，山门和大殿的柱子多是深山老林里采伐的数百年乃至千年古木，非常粗壮，直径往往有两人合抱那么粗。屋顶和屋檐为多层歇山式，也全是木制的，露出厚朴、温暖的木纹本色，有的寺院会在屋檐上刷一些白色油漆，此外几乎没有华丽的装饰。
另外，日本寺院的构成也像我国唐宋时期，主要的建筑是山门、大殿、法堂、方丈、钟鼓楼等，不像我国的寺院有四大菩萨殿、伽蓝殿等。再就是日本一座大的寺院往往是某个派别的大本山，也就是总部的意思，里面还有许多小型的院落，日本人称之为“塔头”，比如临济宗妙心寺派大本山，规模宏大，里面分布有45座小寺院，各有住持者。
日本是一个非常爱清洁的国家，街道、小巷，特别是日本的寺院，到处都非常的干净、整洁，大殿、法堂或方丈室内往往做成塌塌米，要脱鞋才能进入。许多寺院的殿堂门口都设有换鞋的玄关，外面写着“土足严禁”的字样。这一过程虽然略显繁琐，却能增加参观者的庄严肃穆感，学习“照顾脚下”。
下面是一些重点参观寺院的介绍——
三十三间堂
这是访日团在京都参观的第一座寺院，主体建筑主要就是一座长120米的巨型大殿，有好多根巨大的梁柱。大殿里面供奉着1001尊与成年人等高的千手观音像，都是当时的能工巧匠用手工做成的，神态各异，塑像的眼睛采用嵌入式，因此塑像显得炯炯有神。“三十三”是代表观音菩萨三十二应，同时他们还供奉了一尊“圣观音”。因为不让拍照，所以无法展示里面的壮观景象，只能看到外面的样子。明基大和尚带领大家在大殿内念诵心经，并回向。此后，几乎到每家寺院都有同样的举动。
本能寺
这家寺院是法华宗的大本山，藏身在一条繁华的佛教用品商业步行街内，从外面看不怎么起眼，可是里面的大殿很壮观，也是全木制结构的，大殿布置成塌塌米的样式，里面很整洁，灯具很华丽。大家中午进去的时候，里面空无一人，但大门敞开着，法器一应俱全，大家在里面念诵了一遍心经，然后打坐了十分钟，就像在自己的寺院那么自在。
南禅寺
6月23日下午，一行人来到了南禅寺， 这是日本临济宗的十五大派别之一南禅寺派的大本山，这家寺院的山门很震撼，有“天下龙门”之称，廊柱都是两人合抱的大柱子，一副顶天立地的气概，在某种程度上象征了佛教的担当精神。南禅寺是日本宇多天皇敕与的匾额，因此被推尊为“五山之上”，享有禅寺的最高荣誉，几度被烧毁，后来又重建。查阅有关资料，它的山门是日本重点文物。
6月24日，一行人驱车一个半小时，前往另一个古都——奈良，参观了两座著名的寺院——东大寺和唐招提寺。
东大寺
东大寺真的很大，尤其是它的大殿，号称全世界最大的木结构大雄宝殿，那可是雄奇壮丽，人在里面显得特别渺小。它是华严宗的寺院，大殿正中供奉毗卢遮那佛。
东大寺还有一个“人鹿同欢”的有趣场面，寺院内聚集了大量的梅花鹿，小贩们卖一种鹿吃的饼干，游人买了喂养，结果频频出现梅花鹿追着游人讨饼干的场景，崇谛法师和崇朗法师都被梅花鹿追着跑，这一场景说明日本的自然环境保护做得很好。
唐招提寺
说到唐招提寺，大家就会想到大唐高僧鉴真大师，他老人家受到日本留学生的邀请，作为朝廷“传戒大师”决心前往日本，他克服了失明等种种磨难，于公元753年65岁的高龄第六次东渡才成功抵达日本，公元759年，他建立了学习戒律的寺院“唐律招提”。穿过南大门正面看到的就是“金堂”，它是这座寺院的代表性建筑，堂内并排安放着卢舍那佛坐像、药师如来立像、千手观音立像，都是日本的国宝。
其中特别值得一提的是御影堂，这里供奉的鉴真大师坐像已成为日本的国宝，此外还有鼓楼供奉着鉴真大师从唐朝带去的佛舍利，因此也被称为舍利殿。
唐招提寺是中日友好的重要象征，所以中国重要的国家领导人去日本，一定会去拜会，据了解，当年邓小平在中日邦交正常化之初，就曾到招提寺参观，并拜祭了鉴真大师。
妙心寺
妙心寺是日本临济宗的一个重要派别，是日本最大的寺院，在日本全国拥有3500座寺院，可谓举足轻重。位于京都的妙心寺派大本山规模宏大，其内部拥有46座寺院，一行人在这里拜会了则竹秀南长老和岭兴岳长老，然后由一位下院的住持带领大家参观了一些重要的殿堂和古迹。
妙心寺最负盛名的是法堂，兼具大雄宝殿的功能，这座木结构的建筑除了外形壮观，里面也很特别，穹顶上有一幅气吞云宵、堪称大师级作品的天龙，目前已经成为日本重点文物，它象征着佛教里的护法神，无论从哪个角度看这条龙，都能感觉到龙的双眼直视着你。
相国寺
临济宗相国寺派大本山最早建成于1392年，是奉天皇之命建成的，花费了10年的时间，名列京都五山之首，高僧辈出，它的开山祖师是日本著名的梦窗大师。
寺院虽然经过了多次灾祸，但历代皇亲贵戚和高官都捐资建设，目前这座大本山拥有90余座寺庙，其中的金阁寺、银阁寺颇负盛名，成为京都的重要标志之一。相国寺的法堂也是重点文物，和妙心寺一样，穹顶上有一幅蟠龙图，人在下面击掌，能感觉到龙在上面共鸣，同时有强烈的振动感，很神奇。
瑞严寺
在日本最后一天的上午到了当年大地震的仙台海边参观了瑞严寺，它属于日本临济宗妙心寺派，山门口写着“无门关提唱”，典型的临济宗风格。据日本郡山女子大学何燕生教授介绍，这座寺院已故的平野宗净长老是净慧长老的至交，有点像兄弟情谊，他曾经请裁缝做了两件海青，一件给自己，一件给老和尚。平野长老喜欢搜寻购买佛教文物，遇到他认为对中国有价值的文物，就买下来送给净慧长老。大概90年代中期，瑞严寺青龙殿宝物馆落成，平野长老特地请老和尚前来剪彩，老和尚欣然应约，这也是他惟一一次前往日本东北地区寺院访问。
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